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Plant Transcription Factor Database
v4.0
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Phylogenetic Tree for
Panicum virgatum
M-type_MADS Family
Phylogenetic tree for domain ? help Back to Top

      /------------------------------------------------------------------- Pavir.5KG297000.1.p/86-115  (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- Pavir.6NG327900.1.p/39-88   (3)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- Pavir.6KG380000.1.p/39-88   (54)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- Pavir.J642900.1.p/39-88     (55)
      |                                                                               
      |                                                           /------- Pavir.6KG278500.1.p/18-65   (2)
      |                                                           |                   
      |                                              /-----99-----+------- Pavir.6NG180900.1.p/18-44   (20)
      |                                              |            |                   
      |                                              |            \------- Pavir.5NG401400.1.p/18-65   (51)
      |                                              |                                
      |                                       /--85--+            /------- Pavir.2NG122200.1.p/16-62   (18)
      |                                       |      |      /--99-+                   
      |                                       |      |      |     \------- Pavir.2KG161800.1.p/16-62   (26)
      |                                       |      \--92--+                         
      |                   /---------94--------+             \------------- Pavir.2KG161700.1.p/16-62   (44)
      |                   |                   |                                       
      |                   |                   |                   /------- Pavir.6KG163800.1.p/31-75   (9)
      |                   |                   \--------100--------+                   
      |                   |                                       \------- Pavir.4KG054200.1.p/31-75   (45)
      |                   |                                                           
      |                   |                                       /------- Pavir.5KG722400.1.p/22-53   (4)
      |                   |                                 /-100-+                   
      |                   |                                 |     \------- Pavir.J504400.1.p/22-53     (12)
      |                   |                                 |                         
      |                   |                                 |------------- Pavir.5KG723900.1.p/14-52   (8)
      |                   |                                 |                         
      |                   |                          /--78--+------------- Pavir.5KG345600.1.p/12-48   (13)
      |                   |                          |      |                         
      |                   |                          |      |------------- Pavir.5KG716100.1.p/11-52   (24)
      |                   |                          |      |                         
      |                   |                          |      |     /------- Pavir.2KG224700.1.p/4-45    (57)
      |                   |                          |      \--84-+                   
      |                   |             /-----97-----+            \------- Pavir.7KG126500.1.p/21-62   (58)
      |                   |             |            |                                
      |                   |             |            |            /------- Pavir.5NG350100.1.p/11-49   (5)
      |                   |             |            |            |                   
      |                   |             |            |            |------- Pavir.2NG219900.1.p/11-52   (17)
      |                   |             |            \-----99-----+                   
      |                   |             |                         |------- Pavir.9KG525300.1.p/205-233 (48)
      |                   |             |                         |                   
      |                   |             |                         \------- Pavir.5KG231400.1.p/11-52   (62)
      |                   |             |                                             
      |                   |      /--97--+                         /------- Pavir.5KG078600.1.p/1-25    (10)
      |                   |      |      |                         |                   
      |                   |      |      |            /-----97-----+------- Pavir.8KG311400.1.p/48-85   (25)
      |                   |      |      |            |            |                   
      |                   |      |      |            |            \------- Pavir.5NG080200.1.p/10-52   (41)
      |                   |      |      |            |                                
      |                   |      |      |     /--51--+            /------- Pavir.1NG284500.1.p/11-52   (47)
      |                   |      |      |     |      |      /--99-+                   
      |            /--97--+      |      |     |      |      |     \------- Pavir.1KG322300.1.p/10-53   (60)
      |            |      |      |      |     |      \--76--+                         
      |            |      |--72--+      \--89-+             \------------- Pavir.9NG223700.1.p/11-50   (52)
      |            |      |      |            |                                       
      |            |      |      |            |                   /------- Pavir.5NG294400.1.p/9-48    (31)
      +            |      |      |            \--------100--------+                   
      |            |      |      |                                \------- Pavir.5KG183900.1.p/11-49   (40)
      |            |      |      |                                                    
      |            |      |      |                                /------- Pavir.J272800.1.p/12-50     (16)
      |            |      |      |                          /-100-+                   
      |            |      |      |                          |     \------- Pavir.3KG138300.1.p/12-51   (38)
      |            |      |      \------------84------------+                         
      |            |      |                                 \------------- Pavir.4KG233600.1.p/11-56   (19)
      |            |      |                                                           
      |            |      |                                       /------- Pavir.4KG209500.1.p/20-64   (6)
      |            |      |                                       |                   
      |            |      |                                       |------- Pavir.4NG204500.1.p/20-63   (28)
      |            |      |                          /-----100----+                   
      |            |      |                          |            |------- Pavir.4NG227300.1.p/22-63   (35)
      |            |      |                          |            |                   
      |      /--99-+      |                          |            \------- Pavir.4NG204700.1.p/34-65   (49)
      |      |     |      |                          |                                
      |      |     |      |                          |            /------- Pavir.3KG244300.1.p/24-66   (22)
      |      |     |      |------------99------------+-----99-----+                   
      |      |     |      |                          |            \------- Pavir.3NG153600.1.p/24-66   (46)
      |      |     |      |                          |                                
      |      |     |      |                          |      /------------- Pavir.4KG241600.1.p/15-58   (27)
      |      |     |      |                          |      |                         
      |      |     |      |                          \--100-+     /------- Pavir.8NG209600.1.p/16-56   (29)
      |      |     |      |                                 \--80-+                   
      |      |     |      |                                       \------- Pavir.4NG163500.1.p/16-56   (34)
      |      |     |      |                                                           
      |      |     |      |                                       /------- Pavir.2NG032000.1.p/12-58   (21)
      |      |     |      |                                 /-100-+                   
      |      |     |      |                                 |     \------- Pavir.2KG045600.1.p/12-58   (50)
      |      |     |      \---------------100---------------+                         
      |--100-+     |                                        |     /------- Pavir.5NG313900.1.p/12-59   (23)
      |      |     |                                        \-100-+                   
      |      |     |                                              \------- Pavir.5KG407600.1.p/12-59   (42)
      |      |     |                                                                  
      |      |     \------------------------------------------------------ Pavir.4KG106900.1.p/9-59    (14)
      |      |                                                                        
      |      |                                                    /------- Pavir.8KG359700.1.p/10-53   (7)
      |      |                                              /-100-+                   
      |      |                                              |     \------- Pavir.8KG374900.1.p/10-53   (30)
      |      |                                              |                         
      |      |                                       /--100-+     /------- Pavir.6KG335800.1.p/10-58   (11)
      |      |                                       |      |     |                   
      |      |                                       |      \--52-+------- Pavir.J460500.1.p/10-58     (43)
      |      |                                       |            |                   
      |      |                                       |            \------- Pavir.6KG337700.1.p/10-58   (59)
      |      \-------------------97------------------+                                
      |                                              |            /------- Pavir.5KG177900.1.p/9-59    (15)
      |                                              |      /--59-+                   
      |                                              |      |     \------- Pavir.5KG175400.1.p/9-59    (36)
      |                                              \--97--+                         
      |                                                     \------------- Pavir.3NG044100.1.p/72-110  (32)
      |                                                                               
      |                                                           /------- Pavir.9KG306400.1.p/44-88   (33)
      |                                                     /--56-+                   
      |                                                     |     \------- Pavir.5KG736600.1.p/11-60   (53)
      |                                                     |                         
      |                                                     |     /------- Pavir.5NG119700.1.p/11-50   (37)
      |                                                     |--99-+                   
      \--------------------------90-------------------------+     \------- Pavir.5NG096100.1.p/42-74   (39)
                                                            |                         
                                                            |------------- Pavir.7NG207900.1.p/82-106  (56)
                                                            |                         
                                                            \------------- Pavir.8KG132000.1.p/3-50    (61)
                                                                                      

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      Subtree rooted at node 97:

                                                                    /----- Pavir.6KG278500.1.p (2)
                                                                    |                 
                                /----------------100----------------+----- Pavir.5NG401400.1.p (16)
                                |                                   |                 
                                |                                   \----- Pavir.6NG180900.1.p (35)
                                |                                                     
                                |                                   /----- Pavir.8KG374900.1.p (3)
                                |    /--------------100-------------+                 
                                |    |                              \----- Pavir.8KG359700.1.p (32)
                                |    |                                                
                                |    |                         /---------- Pavir.5KG736600.1.p (5)
                                |    |                         |                      
                           /-64-+    |                    /-69-+    /----- Pavir.8KG132000.1.p (55)
                           |    |    |                    |    \-96-+                 
                           |    |    |                    |         \----- Pavir.9KG306400.1.p (58)
                           |    |    |              /--91-+                           
                           |    |    |              |     |         /----- Pavir.5NG119700.1.p (26)
                           |    |    |              |     \---100---+                 
                           |    |    |              |               \----- Pavir.5NG096100.1.p (44)
                           |    |    |              |                                 
                           |    |    |         /-82-+          /---------- Pavir.6KG380000.1.p (13)
                           |    |    |         |    |          |                      
                           |    \-99-+         |    |     /-92-+    /----- Pavir.J642900.1.p   (25)
                           |         |         |    |     |    \-83-+                 
                           |         |         |    \-100-+         \----- Pavir.6NG327900.1.p (29)
                           |         |         |          |                           
                           |         |         |          \--------------- Pavir.5KG297000.1.p (28)
                           |         |         |                                      
                           |         |         |-------------------------- Pavir.3NG044100.1.p (27)
                           |         |    /-51-+                                      
                     /--91-+         |    |    |-------------------------- Pavir.7NG207900.1.p (33)
                     |     |         |    |    |                                      
                     |     |         |    |    |-------------------------- Pavir.4KG106900.1.p (36)
                     |     |         |    |    |                                      
                     |     |         |    |    |                    /----- Pavir.5KG175400.1.p (39)
                     |     |         |    |    |---------98---------+                 
                     |     |         \-80-+    |                    \----- Pavir.5KG177900.1.p (43)
                     |     |              |    |                                      
                     |     |              |    \-------------------------- Pavir.9KG525300.1.p (57)
                     |     |              |                                           
                     |     |              |                    /---------- Pavir.J460500.1.p   (11)
                     |     |              |                    |                      
                /-57-+     |              \---------100--------+    /----- Pavir.6KG337700.1.p (12)
                |    |     |                                   \-100+                 
                |    |     |                                        \----- Pavir.6KG335800.1.p (18)
                |    |     |                                                          
                |    |     |                                   /---------- Pavir.2KG161700.1.p (8)
                |    |     |                                   |                      
                |    |     \----------------100----------------+    /----- Pavir.2NG122200.1.p (22)
                |    |                                         \-100+                 
                |    |                                              \----- Pavir.2KG161800.1.p (24)
           /-53-+    |                                                                
           |    |    |                                              /----- Pavir.4KG054200.1.p (49)
           |    |    \----------------------100---------------------+                 
           |    |                                                   \----- Pavir.6KG163800.1.p (54)
           |    |                                                                     
           |    |                                                   /----- Pavir.5NG313900.1.p (4)
           |    |                                              /-100+                 
           |    |                                              |    \----- Pavir.5KG407600.1.p (14)
           |    \----------------------100---------------------+                      
           |                                                   |    /----- Pavir.2KG045600.1.p (7)
           |                                                   \-100+                 
           |                                                        \----- Pavir.2NG032000.1.p (50)
           |                                                                          
           |                                                        /----- Pavir.8NG209600.1.p (23)
      --100+                                                   /-100+                 
           |                                                   |    \----- Pavir.4NG163500.1.p (60)
           |                                              /-99-+                      
           |                                              |    \---------- Pavir.4KG241600.1.p (41)
           |                                              |                           
           |                                              |         /----- Pavir.4NG204700.1.p (31)
           |                                        /--89-+         |                 
           |                                        |     |    /-99-+----- Pavir.4NG204500.1.p (56)
           |                                        |     |    |    |                 
           |                                        |     \-100+    \----- Pavir.4KG209500.1.p (61)
           |                                   /-99-+          |                      
           |                                   |    |          \---------- Pavir.4NG227300.1.p (42)
           |                                   |    |                                 
           |                                   |    |               /----- Pavir.3KG244300.1.p (40)
           \-----------------95----------------+    \------100------+                 
                                               |                    \----- Pavir.3NG153600.1.p (51)
                                               |                                      
                                               \-------------------------- Pavir.4KG233600.1.p (47)
                                                                                      
      Root part of tree:

      /------------------------------------------------------------------- Pavir.8KG311400.1.p (1)
      |                                                                               
      |                                                           /------- Pavir.5NG080200.1.p (20)
      |----------------------------100----------------------------+                   
      |                                                           \------- Pavir.5KG078600.1.p (30)
      |                                                                               
      |                   /----------------------------------------------- (97)
      |                   |                                                           
      |                   |                          /-------------------- Pavir.5KG723900.1.p (9)
      |                   |                          |                                
      |                   |                   /--91--+      /------------- Pavir.5KG716100.1.p (37)
      |                   |                   |      |      |                         
      |                   |                   |      \--90--+     /------- Pavir.7KG126500.1.p (45)
      |                   |             /-100-+             \--95-+                   
      |                   |             |     |                   \------- Pavir.2KG224700.1.p (59)
      |            /--96--+             |     |                                       
      +            |      |             |     \--------------------------- Pavir.5KG345600.1.p (34)
      |            |      |      /--94--+                                             
      |            |      |      |      |                         /------- Pavir.5NG350100.1.p (19)
      |            |      |      |      |                   /--73-+                   
      |            |      |      |      |                   |     \------- Pavir.5KG231400.1.p (53)
      |            |      |      |      \--------100--------+                         
      |            |      |      |                          \------------- Pavir.2NG219900.1.p (21)
      |            |      \--84--+                                                    
      |      /--98-+             |                                /------- Pavir.J504400.1.p   (38)
      |      |     |             |---------------100--------------+                   
      |      |     |             |                                \------- Pavir.5KG722400.1.p (62)
      |      |     |             |                                                    
      |      |     |             |                                /------- Pavir.5NG294400.1.p (46)
      |      |     |             \---------------100--------------+                   
      |      |     |                                              \------- Pavir.5KG183900.1.p (52)
      \--68--+     |                                                                  
             |     |                                              /------- Pavir.3KG138300.1.p (15)
             |     \----------------------100---------------------+                   
             |                                                    \------- Pavir.J272800.1.p   (48)
             |                                                                        
             |                                              /------------- Pavir.9NG223700.1.p (6)
             |                                              |                         
             \----------------------100---------------------+     /------- Pavir.1KG322300.1.p (10)
                                                            \-100-+                   
                                                                  \------- Pavir.1NG284500.1.p (17)